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    重慶師范大學杜習慧團隊在羊肚菌屬基因組的微衛星(SSR)挖掘、種質資源評價和品種鑒定方面取得新進展


    【發布日期】:2019-05-13  【來源】:易菇網
    【核心提示】:篩選出合適的分子標記對我國目前主栽培品種構建DNA 指紋圖譜和遺傳多樣性分析,對羊肚菌栽培品種的準確鑒定、知識產權的保護和新品種選育具有重要指導意義。
      作為我國食用菌行業近幾年異軍突起的一類真菌,羊肚菌在國內備受關注,隸屬于羊肚菌屬(Morchella),包括黑色羊肚菌、黃色羊肚菌和變紅羊肚菌三大類。其中,黑色羊肚菌部分物種的成功栽培,使羊肚菌的人工種植自 2012 年起在國內迅速擴張,幾乎各地均有栽培。由于羊肚菌菌種市場長期存在菌種雜亂的現象,菌種名稱混亂且質量參差不齊,損害了育種者的積極性和菇農的利益。因此,篩選出合適的分子標記對我國目前主栽培品種構建DNA 指紋圖譜和遺傳多樣性分析,對羊肚菌栽培品種的準確鑒定、知識產權的保護和新品種選育具有重要指導意義。
      近日,重慶師范大學杜習慧老師團隊以國內主要羊肚菌栽培物種梯棱羊肚菌(M. importuna)、六妹羊肚菌(M. sextelata)、七妹羊肚菌(M. eximia)、頭絲羊肚菌(M. exuberans)、Mel-13 和 Mel-21 為研究對象,以各物種的野生樣品和不同栽培品種樣品為研究材料,基于梯棱羊肚菌基因組序列,開展研究并得到以下結果:1)首次對梯棱羊肚菌基因組內 SSR 的分布和構成進行了分析,結果顯示梯棱羊肚菌基因組內有 12902 個 SSR 位點構成,其中單核苷酸單元重復的 SSR 最多(66.2%),其次分別是三核苷酸(15.4%)、二核苷酸(12.1%)、四核苷酸(3.7%)、五核苷酸(1.3%)和六核苷酸(1.3%)單元重復;2)篩選出 180 對 SSR引物對上述六個物種的 24 份代表樣品進行初步分析,發現 SSR 在這些物種間具有很高的轉移率(87.7%),位點的擴增成功率與物種間的親緣關系成正比;3)進而篩選出22對SSR引物對上述六個物種的127份樣品進行深入分析,結果顯示22個SSR位點在各物種內部具有較高的遺傳多樣性,同時檢測到這些物種間具有雜交現象,并證實所使用的91個栽培樣品均為不同的品種,具有不同的基因型,菇農所使用的菌種名稱混亂,同物異名異物同名現象嚴重。以上研究結果在羊肚菌菌種遺傳多樣性分析、菌種鑒定、品種選育和知識產權保護等方面具有重要的應用價值。
      目前,該研究成果以“Hybridization, characterization and transferability of SSRs in thegenus Morchella ” 為 題 在 線 發 表 于 Fungal Biology 上 。 文 章 鏈 接 :https://doi.org/10.1016/j.funbio.2019.05.005
    QQ截圖20190513162515
    Fig. 1 基于 SSR 標記對 127 份羊肚菌樣品的群體結構分析、主成分分析和 UPGMA 聚類圖
    QQ截圖20190513162601
    Fig. 2 梯棱羊肚菌(M. importuna)、六妹羊肚菌(M. sextelata)、七妹羊肚菌(M. eximia)、頭絲羊肚菌(M. exuberans)、Mel-13 和 Mel-21 的群體結構分析和主成分分析
    QQ截圖20190513162653
    Fig. 3 SSR 位點擴增失敗率與物種間的親緣關系
     
     
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